Идея создания Независимого института философии принадлежит Юлии Синеокой, экс-заместителю директора по научной работе и экс-заведующей сектором истории западной философии Института философии Российской академии наук, живущей с февраля 2022 года во Франции. Осенью 2022 года она начала восстанавливать коммуникацию между философами, покинувшими Россию из-за несогласия с войной России против Украины.

Логотип ассоциации отсылает к ее первоначальному рабочему названию Fire Exit придуманному на одной из встреч Юлии Синеокой с Александром Доброхотовым. 13 октября 2022 года состоялось первое онлайн собрание, на котором присутствовало 16 человек. С этого дня собрания ассоциации проходят еженедельно по субботам: заслушиваются и обсуждаются доклады и решаются вопросы, связанные с работой ассоциации. Число участников меняется. К моменту юридической регистрации ассоциации в Париже в мае 2023 года число ее членов приблизилось к сорока. В соответствии с французским законодательством официальными основателями ассоциации являются Юлия Синеокая и Алексей Жаворонков. 22 апреля 2023 года Учредительное собрание ассоциации, на котором присутствовало 35 человек, избрало в Совет ассоциации: Юлию Синеокую (президент), Алексея Жаворонкова (казначей), Александру Бердникову (секретарь). 9 мая 2023 Независимый институт философии получил регистрацию в Префектуре Парижа.

Наряду с философами в ассоциацию входят филологи, социологи, историки, психологи, писатели. Ассоциация объединяет российских, украинских, европейских и американских ученых, принадлежащих к разным поколениям.